Nazwa zabytku nawiązuje do działających niegdyś w pobliżu młynów, zakłady były napędzane nurtem pracowitej Strzyży. Już w XVII wieku w okolicy funkcjonował dwór, którym swego czasu (1676 r.) zainteresowała się królowa Marysieńka. Monarchini zabawiła tu ponoć aż pięć dni. Kolejny dworek zbudowano pod koniec XVIII wieku z inicjatywy kupca Brunna.
W 1807 roku walory dworskiego założenia docenił napoleoński gubernator Jean Rapp, który z dworu Młyniska uczynił swoją letnią rezydencję i lokum dla gdańskiej wybranki Julii Buttcher. Niestety w 1813 roku budynek został zniszczony, w tym zaciekłym oblężeniu Gdańska bezpowrotnie przepadło wiele miejskich budynków, również tych o walorach zabytkowych. Pałacyk odbudowano w roku 1820 według klasycystycznych założeń architektury.
Zobacz też – Jak obniżyć koszty budowy wymarzonego domu?
W 1973 roku obiekt został wpisany na listę zabytków. Po gruntownych pracach renowacyjnych budynek służy jako siedziba zarządu Elektrociepłowni Wybrzeże. Zabytkowy dworek kapitalnie kontrastuje z fabryczną zabudową okolicy .
